На водных объектах преобладает спад уровней воды различной интенсивности.

На участке р. Вилюй Крестях – Сунтар в пределах Сунтарского района отмечается рост уровней воды на 10-20 см за сутки.

Уровни воды наблюдаются ниже проектных отметок лимитирующих судоходство: на всем протяжении р.Яна и на участке р.Индигирка Хонуу – Чокурдах.